В ноябре 1828 года произошло восстановление Саратовской епархии как самостоятельной церковно-административной единицы.

Секретный комитет по делам о раскольниках обращает особое внимание Государя Императора Николая I на усиление раскола в Саратовской губернии. По повелению Николая I, от 20 октября 1828 года, в Саратове, ввиду усиления раскола, была учреждена самостоятельная епископская кафедра. Во исполнение высочайшей воли Синод постановил:

1. Новоучрежденной Саратовской епархии быть в третьем классе и иметь степень под Пензенскою.
2. Будущему епископу именоваться Саратовским и Царицынским, а как название Саратовского присвоено было Пензенскому архиерею, последнего именовать впредь Пензенским и Саранским.
3. Новому епископу иметь пребывание в Саратове, где, впредь до постройки или покупки особого дома за счет казны, помещаться ему в Спасо-Преображенском монастыре, где для временного пребывания архиерея имеются особые кельи.
4. На основании Указов от 26 февраля 1764 г. и 18 декабря 1797 г. к архиерейскому дому Саратовской епархии определить надлежащее число служителей из крестьян экономического ведомства, и отвести из казенных оброчных статей, поблизости и удобности, положенное количество земли с угодьями, мельницей и рыбной ловлей.
5. Что касается до устроения семинарии в Саратовской епархии, предоставить будущему в ней архиерею войти о сем, по устроении епархии, особым представлением, между тем детям священно-церковнослужителей сей епархии продолжать обучаться в тех же семинариях и училищах, где они ныне обучаются, и, по увольнении из них, поступать в распоряжение Саратовского архиерея по принадлежности.
6. Во вновь учрежденную Саратовскую епархию, перевести ныне из действительно служащих епископов дознанной способности, как того требуют местные обстоятельства данной епархии и сама новость ее учреждения, потому Синоду приступить к избранию кандидата, находить способными к тому переведению епископов: первым Моисея Вологодского и Устюжского, вторым Кирилла Вятского и Слободского, с оставлением при них степеней сих епархии, и третьим Амвросия Оренбургского и Уфимского.
7. Тому, кто из сих кандидатов Высочайше назначен будет к переведению в Саратовскую епархию, выдать деньги из государственного казначейства.

3 ноября 1828 года на подлиннике постановления Синода рукою Императора подписано: "Быть по сему" [3,38-40].

Утверждая доклад Св. Синода о восстановлении Саратовской епархии, император Николай I из трех достойных занять кафедру кандидатов остановил свой выбор на Моисее, епископе Вологодском и Устюжском. Так Промыслом Божиим и волею Государя владыка Моисей (Богданов-Платонов) стал первым епископом Саратовским и Царицинским - такое официальное именование получили Саратовские архиереи с 3 ноября 1828 года. Получив 12 ноября из Св. Синода указ о своем назначении, Моисей 22 декабря уже был в Саратове. На Рождество Христово Преосвященный Моисей совершил первое архиерейское служение в кафедральном Александро-Невском соборе. Вот как об этом повествует А.Ф. Леопольдов: "Вот он, наш Моисей, - говорили тогда в Саратове, - изведет нас из работы вражией и поведет нас в землю обетованную, он разгонит этих волков-раскольников, которые сами слили себе тельцов-богов"[3,40].

В ведение Саратовского епископа поступило 545 церквей, более 2500 священно-церковнослужителей и свыше миллиона христианских душ. Первым делом Владыка приступил, как и предписывалось указанием Св. Синода, к устройству важнейших органов епархиального управления - архиерейского дома и духовной консистории, открытие которой состоялось 30 декабря 1828 года. Епископ Моисей осуществлял руководство и надзор за деятельностью консистории и всех других епархиальных органов и учреждений. Оживление церковной жизни Саратова проявилось в восстановлении в 1829 году древнего женского Крестовоздвиженского монастыря. Еще одним не менее важным деянием Преосвященного Моисея было создание Саратовской Духовной семинарии. 13 сентября 1830 года Саратовская консистория издала указ об открытии семинарии и предписала всем воспитанникам Пензенской, Тамбовской, Казанской и Воронежской семинарий, посланным из Саратовской губернии, явиться на занятия в новую бурсу. 26 октября 1830 года состоялся акт открытия семинарии. Первым ректором Саратовской Духовной семинарии был определен бакалавр Санкт-Петербургской Духовной Академии архимандрит Никодим, инспектором был назначен бывший инспектор Рязанской семинарии игумен Иоанн. Богословские науки были поручены отцу ректору. Инспектор преподавал философию. Гражданскую историю и еврейский язык преподавал знаменитый впоследствии Гордий Саблуков. Словесность и французский язык - профессор Константин Сокольский, математику и немецкий язык - учитель Иван Синайский. В декабре 1830 года в Саратовской Духовной семинарии числилось 289 учеников [2,87].

Итак, с восстановлением Саратовской епархии, с учреждением в Саратове самостоятельной архиерейской кафедры духовная жизнь обширной губернии получила новые мощные импульсы для своего развития. Епископу Моисею с помощью епархиального духовенства и при деятельной поддержке благочестивых мирян удалось с честью выполнить возложенную на него миссию.

12 марта 1832 года указом Св. Синода Преосвященный Моисей был назначен членом Синода и экзархом Грузии с возведением в сан архиепископа Карталинского и Кахетинского [4,344].

Саратовскую кафедру занял епископ Иаков (Вечерков). Он управлял епархией 15 лет до перемещения в 1847г на Нижегородскую кафедру. С его именем связано решительное распространение единоверия среди старообрядцев и обращение в православие тысяч калмыков и евреев. Владыка всегда заботился о благосостоянии Саратовской Духовной семинарии. Трудами Преосвященного были открыты три новых Духовных училища: в Николаевске - в 1845 г., в Вольске и Балашове - в 1847 г. Епископ Иаков вошел в историю и как неутомимый строитель. В Саратовской епархии им было построено много церквей и молитвенных домов. В 1837г. был построен просторный архиерейский дом с крестовой церковью, освященной во имя Успения Божией Матери. Этот дом сохранился до наших дней. С 1992 года в нем размещается возрожденная Саратовская Духовная семинария [2,89].

Владыку Иакова сменил на Саратовской кафедре не менее просвещенный епископ Афанасий (Дроздов): 13 января 1847 года указом Св. Синода с Винницкой архиерейской кафедры он переводится в Саратов. Помимо четырех европейских языков и обязательных греческого и латыни, епископ Афанасий в совершенстве знал египетский, ассирийский, санскрит и древнееврейский языки. Удаленный из Петербурга, Афанасий прибыл в Саратов навсегда огорченным замкнутым человеком. При Афанасии Св. Синод нашел необходимым образовать викариатство. Викарию Саратовской епархии было указано именоваться епископом Вольским и местопребывание иметь в этом городе. Первым викарием стал епископ Антоний (Шокотов), хиротония которого состоялась 2 сентября 1850 г в Санкт-Петербурге. В 1856 году архиепископ Афанасий был приведен из Саратова в Астрахань. 6 апреля 1870 года архиепископ Афанасий увольняется на покой [2,91].

В 1856 году Афанасия (Дроздова) сменил Иоанникий (Горский), переведенный из Старой Руссы. Забота Преосвященного Иоанникия о духовном просвещении распространялась не только на православную паству, но и на старообрядцев. В 1857 году епископ благословил открыть приходское училище для единоверцев.

С 1864 года по 1873 год правящим архиереем был еще один бывший ректор Санкт-Петербургской Духовной Академии епископ Иоанникий (Руднев). При нем в Саратове открылась в 1869 году Женское Епархиальное училище. Преосвященный Иоанникий начал издавать первый духовный журнал "Саратовские епархиальные ведомости". Первый номер вышел в 1865г. О таком журнале мечтал еще епископ Иаков (Вечерков), но Синод нашел тогда это мероприятие преждевременным [2,94].

С 1873 по 1882 год епархией управлял Преосвященный Тихон (Покровский), магистр Санкт-Петербургской Духовной Академии. Обладая всеми качествами администратора и архипастыря, он был в то же время светским человеком, которого любили и общество и власть. Владыка был замечательным проповедником, неутомимо посещал не только города, но и села своей епархии.

С 1882 года Саратовской епархией управлял епископ Павел (Вильчинский). Как и преосвященный Иаков (Вечерков), епископ был в полном смысле слова монахом-аскетом. В Саратове его считали прозорливым. В 1889 году епископ Павел был переведен на Астраханскую кафедру.

С 1889 по 1893 год правящим архиереем был епископ Авраамий (Летницкий), умерший в Саратове. До Саратова он четыре года был епископом Тобольским и Сибирским. В Сибири он не только был знаком, но и исповедовал знаменитого старца Федора Кузьмича, в котором подозревали отказавшегося от престола Императора Александра I. Владыка Авраамий свято хранил тайну исповеди и загадку сибирского старца не раскрыл никому [2,95].

Во время пребывания на Саратовской кафедре (1893-1899) епископа Николая (Налимова) Саратов посетил о.Иоанн Кронштадский. В 1898 было вновь учреждено Вольское викариатство. Первым, после возобновления, Вольским епископом стал Никон (Софийский).

После назначения епископа Николая на Выборгскую кафедру, Саратовской епархией с 1899 по 1903 год управлял епископ Иоанн (Кратиров), магистр Московской Духовной Академии. В течение 10 лет он был редактором одного из лучших в России журналов богословско-философского направления "Вера и Разум". 13 июня 1900 года Преосвященный Иоанн утвердил решение Саратовского епархиального съезда об открытии второго Епархиального женского училища в Вольске.